本發(fā)明提供了一種基于兩路多分支CNN的單步逆合成方法及系統(tǒng)，其中的方法在進(jìn)行單步逆合成預(yù)測(cè)時(shí)，輸入待預(yù)測(cè)分子的SMILES序列，經(jīng)過兩路多分支卷積層，特征拼接層，全連接層后，輸出反應(yīng)規(guī)則集能產(chǎn)生該分子的前k條反應(yīng)規(guī)則。根據(jù)輸出的反應(yīng)規(guī)則，結(jié)合待預(yù)測(cè)分子的SMILES，最終計(jì)算得到目標(biāo)分子的反應(yīng)物SMILES，實(shí)現(xiàn)單步逆合成自動(dòng)化。本實(shí)施例還提出一種基于兩路多分支CNN的單步逆合成系統(tǒng)，通過反應(yīng)數(shù)據(jù)集獲取，訓(xùn)練集構(gòu)造，模型構(gòu)建，模型訓(xùn)練，單步逆合成預(yù)測(cè)以及結(jié)果可視化等模塊處理過程，實(shí)現(xiàn)了目標(biāo)分子的單步逆合成自動(dòng)化。本發(fā)明成果既可用于化學(xué)逆合成領(lǐng)域，也可用于生物逆合成領(lǐng)域，具有比現(xiàn)有方法更廣泛的用途。